У даній роботі сформульовано алгоритм системного аналізу з метою вивчення причин та особливостей динаміки розвитку і перебігу захворювання. З усієї множини альтернатив наукових напрямків систезовано напрямок, що базується на вивченні загального патологічного процессу з точки зору теорії динамічних систем.