Клоновую нейросеть составляют четыре многослойных нейросети: рецепторная (Р), эффекторная (Э), проприоцепторная (П) и санкционирующая (С), а также 5 видов межнейронных связей. Клоновая нейросеть преобразует пространственно-временной паттерн входных сигналов в пространственно-временной паттерн управляющих сигналов рабочих органов посредством модификации связей в течение одной итерации.