Выполнен анализ основных проблем учета и оптимизации рисков и неопределенностей, возникающих при реализации организационных проектов по реструктуризации наукоемких предприятий. Указаны основные направления риск менеджмента и приведена система концепции оценки риска в ходе выполнения проектов с большой степенью неопределенности на примере научно-производственного комплекса газотурбостроения "Зоря"-"Машпроект".