Рассмотрены структура и целевые показатели процессов деятельности, реализуемых сложной организационной системой в части информационной поддержки принятия решений, а также возможности оптимизации системы целевых показателей. Приведены алгоритмы и модели компьютерной реализации информационной поддержки принятия решений.