Предложены элементы методологии анализа функциональной безопасности информационно-управляющих систем (ИУС), включающие: принципы анализа функциональной безопасности ИУС, теоретико-множественную модель и ER-модель рисков, процедуру сравнительного анализа рисков, теоретико-множественную и вероятностную модели эшелонирования защиты активов, метод повышения функциональной безопасности ИУС. Ключевые слова: функциональная безопасность, анализ рисков, информационно-управляющая система.