С позиций биосистемной аналогии рассмотрены методологические вопросы проектирования сложных кибернетических систем, к которым в полной мере относятся средства мониторинга безопасности информационных систем (ИС). Предложен подход к построению защищенных ИС, определяющий основные положения и методологию создания защищенных интеллектуальных ИС. Подход основан на аналогии архитектуры и механизмов защиты биологических систем и сложных кибернетических систем. Ключевые слова: биосистемная аналогия, защита информации, интеллектуальные системы защиты, базы знаний, адаптивные классификаторы.