В статье рассматриваются ключевые проблемы, возникающие при проектировании сложных программных систем и алгоритмов. Раскрыта фактология стадий проектирования, методологический инструментарий моделирования. Даны практические рекомендации для построения локального контекста проектирования и создания целостной среды моделирования и синтеза структуры алгоритма.