Биогенное загрязнение малых водотоков стоками, поступающими с мелиоративных осушительных систем, рассмотрено с точки зрения стохастического процесса. По результатам натурных наблюдений выделены лимитирующие периоды. Для построения кривых обеспеченности при недостатке натурной информации предусматривается удлинение рядов с помощью математического моделирования методом Монте-Карло. Предложена методика назначения концентрации нормативно-допустимых сбросов дренажных вод с учетом стохастического характера процесса загрязнения. Ключевые слова: нечерноземная зона РФ, малая река, мелиоративные осушительные системы, биогены, лимитирующие периоды, стохастический процесс, кривые обеспеченности, математическое моделирование, управление качеством водных ресурсов.