Целью данной работы является определение путей создания аналитического ядра информационно-аналитической системы по программе "Протеом человека". Отмечены основные направления работ: применение нейросетевых суперкомпьютерных технологий в молекулярном моделировании в медицине и биоинженерии; использование нейросетевых технологий и методов семантического анализа для систематизации постгеномных данных; проведение исследований в области выявления структурно-функциональных взаимосвязей в белках методами смыслового дешифрования первичной структуры. Ключевые слова: нейросетевые технологии, геном, протеом, классификация, кластеризация, текстовая обработка.