Рассматриваются вопросы управления кооперацией сторон при выполнении инновационных проектов телекоммуникационной отрасли. Инновационные проекты в данной отрасли затрагивают, как правило, все сферы и уровни деятельности предприятия. Поэтому предлагается подход, состоящий в последовательной декомпозиции целей заказчика и исполнителя проекта по уровням иерархии, их сопоставлении, определения доминирующих целей для каждой стороны. Системное представление целей сторон проекта и самого проекта позволяет каждому его участнику прогнозировать поведение партнёров, с тем, чтобы продуктивно планировать использование ресурсов, четко определять приоритеты при выстраивании взаимоотношений на каждом этапе жизненного цикла проекта, эффективно управлять рисками. Ключевые слова: управление инновационным проектом, иерархия целей предприятия и проекта, системное представление, жизненный цикл проекта.