Рассмотрена возможность персонифицирования физиотерапевтической процедуры путем индивидуального подбора параметров лечебного воздействия на основе оперативной оценки текущего функционального состояния пациента. Для повышения достоверности оценки текущего функционального состояния процесс формирования диагностического заключения представлен в виде связанных этапов селекции информативных параметров исходного сигнала, выявления информативных признаков, служащих маркерами изменения функционального состояния организма, и принятия решения с использованием нейросетевых технологий. Предложены методы реализации каждого из этапов.