Рассматривается система автоматизации научных исследований в применении к задаче прогнозирования развития опорной транспортной сети России. Описан процесс формирования, расчета и анализа прогнозируемых вариантов. Введенные в работе методы комбинирования вариантов позволяют реализовать концепцию ситуационной комнаты, предоставляющую пользовательский интерфейс для лиц, принимающих решения. Ключевые слова: автоматизированная система научных исследований, ситуационная комната, развитие транспортной системы