Предложены и проанализированы некоторые методы и способы информационно-технологической поддержки трансдисциплинарных научных исследований в их становлении и развитии. Сделан акцент на онтолого - руководимых сервис-ориентированных системах представления знаний в глобальной сетевой среде.