Излагается комплекс моделей, алгоритмов и программ, разработанных для управления высокопроизводительной гетерогенной специализированной вычислительной системой, выполняющей разнородные задания. Представлена многопараметрическая модель, предназначенная для управления обработкой ресурсоемких разнородных вычислительных заданий, допускающих распараллеливание по данным. Модель опирается на методологию исследования операций, и для управления в условиях объективной неопределенности в ней используется принцип гарантированного результата. В процессе диспетчеризации в каждой контрольной точке вычисляются максиминные оценки неизвестных величин (время пребывания в системе, длительность обработки и др.), на основании которых формируются диспетчерские управляющие команды. Указанный подход позволит на практике реализовать принципиально новую дисциплину обслуживания, при которой в первую очередь решаются наименее ресурсоемкие задачи.