Ставится и решается задача согласования взаимодействий разнородных транспортных систем при доставке грузов потребителям. Анализируются возможные варианты организации пунктов перегрузки (ПП) грузов с учетом возможного складирования и дополнительной транспортировки. Проводится оптимизация размещения ПП и выбора их состава с учетом возможных логистических издержек с применением метода целочисленного линейного программирования. Описана многокритериальная постановка задачи оптимизации и введен комплексный критерий для оценки логистических задач. Предложена агентная модель для исследования материальных потоков в разнородных транспортных сетях. Ключевые слова: разнородные транспортные сети, перегрузка грузов, оптимизация логистических издержек, агентное моделирование.