Рассмотрены вопросы безопасности систем информационного взаимодействия. Делается попытка системного анализа основных проблем безопасности, в частности, причин и источников уязвимостей, способов проникновения в систему вредоносного программного обеспечения (ВПО) и методы борьбы с ним. Такой подход позволяет повысить эффективность решения задачи по сравнению с традиционным утилитарным стилем, использующим отдельные, слабосвязанные приемы, методы и средства обеспечения информационной безопасности. В качестве главных объектов анализа предложены и использованы логические каналы, среда исполнения и сервис среды исполнения. Отдельно рассмотрены также проблемы использования существующих средств борьбы с ВПО, показана актуальность разработки комплексных средств борьбы с ВПО для использования специалистами различной квалификации, в том числе и для некоммерческого применения. Ключевые слова: информационные системы, информационное взаимодействие, логический канал, протокол, уязвимость, информационная безопасность