Для анализа и оценки неопределенности результатов инновационного проекта он рассматривается как сложная техническая система, в которой степень достижения заданных тактико-технических характеристик разработки моделируется кумулятивной вероятностью ее технического успеха. Показано, что указанная вероятность подчиняется закону Вейбулла. Эта вероятность безотказного исполнения работы проекта служит показателем надежности работы и позволяет получить оценку снизу гарантированной надежности всего проекта. Двухкритериальная задача (время, стоимость) представляется в виде минимизации по последовательно применяемым критериям, реализуя лексикографический метод упорядочивания решения задач векторной оптимизации. Для однокритериальных выпуклых задач, исходные данные которых известны неточно, применяется регуляризованный метод их решения. Разработанная модель и метод решения двухкритериальной задачи используются для создания интегрированной системы планирования инновационных проектов.