В статье представлена классификация методологических принципов организационно-технического управления процессами защиты информации на объектах информационно-телекоммуникационных систем специального назначения на базе системного подхода, обеспечивающих учет основных факторов, влияющих на функционирование систем защиты информации от несанкционированного доступа, которая позволяет решать различные управленческие задачи, включая задачи, связанные с автоматизированным контролем ее эффективности, что позволяет снизить риски несанкционированного доступа к потенциально опасным объектам.