Разработана структура многоканального доплеровского фильтра в условиях обработки неэквидистантных пачек импульсов, проанализирована эффективность доплеровского фильтра. Представленный алгоритм позволяет устранить потери в обработке неэквидистантных сигналов, составляющие несколько децибел и оценить объем дополнительных вычислений модифицированного алгоритма по сравнению с классическим алгоритмом фильтрации на основе быстрого преобразования Фурье.