Рассмотрена задача выбора оптимального порядка скрытой марковской модели для распознавания функциональных фрагментов генов. Предложены четыре статистических критерия определения оптимального порядка: на основе отношения правдоподобия, эргодического свойства, марковского свойства и информационного критерия Акаике. Подтвержена эффективность использования для решения рассматриваемой задачи баесовских смесей марковских моделей; с помощью статистических критериев определено оптимальное количество компонент смеси.