У статті розглянуто механізми управління регіональними міжгалузевими зв'язками у сучасній регіональній інноваційній системі та основні форми міжгалузевої інтеграції. Приведено модель регіональних міжгалузевих зв'язків в умовах здійснення кластерної політики, що дозволяє оцінити доцільність їх створення та визначити резерви їх активації.