При помощи вычислительного алгоритма на основе многоуровневой рекомпозиции методом автономных блоков с каналами Флоке разработана математическая модель дифракции электромагнитных волн на образцах анизотропных нанокомпозитных материалов (3D-решеток ориентированных углеродных нанотрубок (УНТ) с магнитными наночастицами и магнитных нанопроволок) в волноводах. Проведен электродинамический расчет коэффициентов прохождения волны H10 с частотой 26 ГГц через пластины магнитных нанокомпозитов в волноводе в зависимости от напряженности внешнего постоянного магнитного поля (поля подмагничивания), а также числа магнитных наночастиц, заполняющих УНТ.