Рассмотрены проблемы выбора алгоритмической реализации параллельной обработки данных на базе ПЛИС. Рассмотрены различные параметры, которые влияют на возможность реализации алгоритма в ПЛИС. Показано, что исследование и оптимизацию процесса разработки целесообразно проводить с помощью методики и средств системного анализа. Проведена формализация критериев выбора формы реализации на основе приведенных показателей. Ключевые слова: ПЛИС, системный анализ, алгоритм, параллельная обработка сигналов, радиолокация, встроенные системы, системы на кристаллах, микроэлектроника, схемотехника, системотехника, проектирование систем.