У статті наведена методика експертного оцінювання функціональних профілів загроз державних інформаційних ресурсів. Дана методика базується на раніше визначених загрозах державним інформаційним ресурсам, які лягли в основу методології побудови їх класифікатора. Методика складається з п'яти основних етапів: складання таблиць опитування експертів, які відповідають будові класифікаторів загроз державним інформаційним ресурсам нормативно-правового, організаційного та інженерно-технічного спрямування; порядку формування складу експертної групи; порядку заповнення таблиць опитування експертами; аналізу експертної інформації; порядку прийняття рішення. Вказані певні протиріччя, які виникають при формуванні експертної групи, загострено увагу на визначенні кількості експертів у зв'язку з неоднозначним підходом до цього питання різних джерел. Наведено приклад розрахунку та прийняття рішення за одним із показників елементу функціонального профілю загроз державним інформаційним ресурсам.