іонні канали, ионные каналы ; кінетика, кинетика ; кальцій, calcium ; фізика живого, физика живого
Канали транзієнтного рецепторного потенціалу (Transient Receptor Potential, TRP) формують несективні Са2+- проникні катіонні канали. Дослідження було проведено на іонному каналі TRPC4, який є рецептор-керованим іонним каналом. Моделі, які б чітко описували переходи між мікростанами каналу, ще потребують удосконалення. Метою роботи було кількісно дослідити активацію каналу TRPC4. Виявлено, що існує щонайменше 3 відкритих та 4 закритих мікростанів. Зв"язки між цими кінетичними станами дослідженні методоммаксимальної правдоподібності та виявлено 3 пари реверсивних зв'язків. Використовуючи програму QuB були розраховані константи швидкості для кожного переходу. Отримана модель може пояснити циклічну активність каналу TRPC4.
Transient receptor potential channels (TRP) are non-selective cation channels, most of which are permeable to Ca2+. The research was conducted on TRPC4 channel, which is the member of the classic subfamily of TRPs. It belongs to the subgroup of receptor-activated ion channels. TRPC4 plays a prominent and well-characterised role in the cholinergic excitation and contraction of gastrointestinal tract. The main aim of our research was to characterize quantitatively TRPC4 channel gating. It was found, that TRPC4 gates in the main 3 open and 4 closed kinetic microstates. The connections between these states have been characterized by the maximum likelihood methods and included 3 pairs of reversible transitions. Furthermore, the rate constants for all individual transitions have been calculated using the QuB software. The model can explain the cyclical behavior of channel activity.
Каналы транзиентного рецепторного потенциала (TRP) являются неселективными катиоными каналами, большинство из которых являются проницаемыми для Са2+.. Исследование было проведено на канале TRPC4 - рецептор-активируемом канале классического подсемейства TRP каналов. Главной целью нашего исследования является количественно охарактеризовать работу канала TRPC4. Выявлено, что существует по меньшей мере 3 открытых и 4 закрытых микросостояний. Связи между этими кинетическими состояниями исследовались методом максимального правдоподобия и было обнаружено 3 пары реверсивних связей. Используя программу QuB были рассчитаны константы скорости для каждого перехода. Полученная модель может объяснить циклическую активность канала TRPC4.
