Методологія фізкультурно-оздоровчої прогностики базується на концепції розвитку природи організму дитини, підлітка , старшокласника, вихованості інетересу в них до занять фізичною культурою в повсякденному житті. Основними методами прогнозування є: спостереження, аналіз і синтез, педагогічний екперемент, інтуїтивне передбачення, гіпотеза, доктрина, концепція, аналогія, індукція і дедукція.